在长期投资决策中，净现值方法被认为是最好的一种方法。运用净现值方法对投资项目进行评价，关键是现金流量及折现率的确定。通常我们运用净现值方法进行决策，只是评价投资项目本身的经济效果。这时折现率通常是指投入资本的机会成本，即投资者在资本市场上，以风险等价的投资所要求的回报率。从折现率的确定上可以看出，每年的营业净现金流量是不能扣除债务利息的，即年营业净现金流量应是：息税前收益×（1－所得税率）＋折旧；而不是我们会计上的： 税后利润＋折旧。这种净现值的计算未考虑债务筹资，即财务风险对项目评价的影响。
实际上，净现值方法也可以将债务筹资的效果考虑进去，即不仅考虑项目本身的经济效果，也考虑筹资结构及筹资成本对项目的影响。以下分别介绍四种可选择的净现值方法。
1.将债务资本的成本考虑在折现率中，即折现率就是项目投入资本的加权平均资本成本。
例如，某项目投入资本100万元，其中50％是权益资本， 资本成本为14％；50％是债务资本，利息率为10％。借入期4年， 每年末付利息，到期还本。设所得税率为40％，项目有效期4年。 采用直线法计提折旧，各年的营业净现金流量预测如表一。
表一 单位：万元
项目 第一年 第二年 第三年 第四年
①营业收入 90 100 120 180
②付现成本 60 65 75 105
③折旧费 25 25 25 25
④息税前收益 5 10 20 50
⑤所得税 2 4 8 20
⑥营业净现金流量 28 31 37 55
※④＝①－②－③；⑤＝④×40％；⑥＝④－⑤＋③
该项目投入资本的加权平均资本成本＝50％×14％＋50％×10％×（1－40％）＝10％
净现值＝28÷（1＋10％）＋31÷（1＋10％）[2]＋37÷（1＋10％）[3]＋55÷（1＋10％）[4]－100＝16.44（万元）
表二 单位：万元
项目 第一年 第二年 第三年 第四年
①营业收入 90 100 120 180
②付现成本 60 65 75 105
③折旧费 25 25 25 25
④利息 5 5 5 5
⑤税前收益 0 5 15 45
⑥所得税 0 2 6 18
⑦营业净现金流量 25 28 34 52
※⑤＝①－②－③－④；⑥＝⑤×40％；⑦＝⑤－⑥＋③
该项目的折现率即权益资本的成本14％。
净现值＝25÷（1＋14％）＋28÷（1＋14％）[2]＋34÷（1＋14％）[3]＋（52－50）÷（1＋14％）[4]－（100－50）＝17.61（万元）
3.根据资本结构理论中的MM理论，将项目净现值分为两个部分：一是项目所需资本全部由权益资本组成时产生的净现值；二是负债税额庇护利益的现值。
设前例中，投入资本全部为权益资本情况下的成本为12％。根据表一给出的营业净现金流量，可计算出净现值的第一部分为11.02万元[28÷（1＋12％）＋31÷（1＋12％）[2]＋37÷（1＋12％）[3]＋55÷（1＋12％）[4]－100]。
第二部分是负债税额庇护利益的现值。因每年支付利息5万元， 因此每年税额庇护利益为2万元（5×40％）；税额庇护利益的现值为6.34万元［2÷（1＋10％）＋2÷（1＋10％）[2]＋2÷（ 1＋10％）[3]＋2÷（1＋10％）[4]］。
由于第二部分的现金流量来源是债务资本，因此其风险与债务资本风险相同，可以按债务资本利息率折现税额庇护利益。
把前两部分合并起来，就可得到：
项目的净现值＝11.02＋6.34＝17.36（万元）
4.从投资者的角度计算项目的净现值。每年的营业净现金流量是由两部分组成的：一是权益资本投资者所获得的现金流量；二是债务资本投资者获得的现金流量。由于负债税额庇护利益体现在权益资本投资者所获得的现金流量中，因此计算加权平均资本成本时，不应再考虑利息的抵税作用。
承前例，从表二中已知权益资本投资者，每年可获营业净现金流量分别为25万元、28万元、34万元、52万元；而债务资本投资者，每年可获净现金流量为5万元。权益资本和债务资本投资者， 每年获净现金流量合计分别为30万元、33万元、39万元、57万元。
加权平均资本成本＝50％×14％＋50％×10％＝12％
净现值＝30÷（1＋12％）＋33÷（1＋12％）[2]＋39÷（1＋12％）[3]＋57÷（1＋12）[4]－100＝17.08（万元）
从以上的计算结果可以看出，从不同角度，采用不同的计算方法，得出的净现值大体相等。