文章要有层次，有条理，这和材料的安排处理关系极大。材料之间的相互关系不同，处理方式也不同，不能错乱，错乱了，层次就不清楚，自然也不会有条理。
例如，平行关系。文章各部分材料之间，没有主从关系，在顺序上谁先谁后都可以，影响不大。例如介绍利润率，有成本利润率，工资利润率，资金利润率等；介绍价格，有消费品价格、生产资料价格、服务价格、土地价格、住宅价格等等，不论先介绍哪一个都可以。
递进关系，有些材料之间的次序不可随意颠倒，递进关系就是这样，这些材料之间是一种一层比一层深入的关系，颠倒了就会造成逻辑混乱。同样以上面的价格为例，如果要结合经济体制改革的进程来谈论它，那就应该先讲消费品价格，因为我们最早承认消费品是商品，其次应介绍生产资料价格，在党的十二届三中全会之后，我们抛弃了传统的“生产资料不是商品”的观点；接下去才介绍服务价格、土地价格、住宅价格，等等，这一类要素价格一直到1992年之后，我们才认识到必须主要由市场形成，以上这种表述，表明了我们认识的不断深化。递进关系处理得好，就能造成步步深入，道理犹如剥茧抽丝，愈转愈隽。
接续关系。前一部分与后一部分有直接的逻辑联系，层次虽分，道理末尽。前一层有未尽之意有待后面续接，不可中断。比如按行进过程顺序安排论据，阐述某些事实，就比较多的采取这一种方式。像在论述股份合作制经济的发展时，作者就往往从起缘、发展、完善这样一个行进过程来层层展开，显得层次清楚，有条有理。
对立关系。文章论述的事理是对立统一体。为正反、表里、前后、质量、胜负、成绩缺点等等。它们有联系又有区别。论述的重点在于阐明它们是辩证的统一，不能将它们孤立地对待。那么在论述时，就不能强调了一面而忽略了另一面。由于毕业学员理论功底不很深厚；辩证思维的方式掌握得不是很好，所以，往往在毕业论文的撰写中犯片面性错误，为强调某一事物的作用，就把其说得好得不得了，通篇都是正面材料，没有任何不足之处；而要否定某一事物，就把其说得差得不得了，通篇都是反面材料，没有任何长足之处，这种论文从结构的角度来说是层次失
衡，有悖常理。
总之，理清了事物间的相互关系，并在结构中体现出来，文章的眉目就清楚了。
四、接榫细密，转折自然古人作文讲究起、承、转、合。起、合是总起、总结问题。承、转是接榫、转折问题。要使文章上上下下浑然一体，没有断裂痕迹，使文气贯通下来，说理有节奏，接榫和转折是不能不注意的问题。
接榫是一部分内容与另一部分内容接头的地方。就像木制家具的“榫头”。凹凸之处，不能大，不能小，要正好合适，做出来的东西才能精美。如接不下、接不紧，就既难看，又不适合，写毕业论文也是如此。一篇论文很好，但一个接榫出毛病，就会铸成错误。因为它在文章中起着承上启下的作用，是上下联系的纽带，稍不留意，就会造成意的脱节。要解决这个问题，就要交代明白联系的媒介与中心环节，通常是通过过渡来实现的。在论文中有段落作过渡，比如，一篇论述农村股份合作制的论文，在介绍了五种不同的开发农村股份合作制形式之后写道“上述这些形式，由于生产要素不同，入股合作的方法也不同，因此，收益分配的比例也有差异。”用这段过渡，接下去就很自然地转到对这几种不同股份合作制形式的收益分配的剖析上。也有以句子作过渡，比如有一学员对邓小平的农业思想指引着××市农业生产不断发展进行论述，先叙述了邓小平同志一系列“农业是根本”的思想，接着要论述××市农业生产在这一思想指引下不断发展的问题，中间就以“在邓小平同志‘农业是根本’的思想指引下，××市对农业重要性认识不断深化”作为过渡，显得很平稳、自然。还有更多的是用词语作过渡，像“所以”、“因此”、“显然”等等都属于这一类。为使过渡得法、得体，必须弄清楚上下两段关系怎样，然后再决定用什么形式把它们联结起来。有些地方需要议论发挥，有的地方需要借曾穿插，有的地方要有比较复杂的判断与推理，不能抽掉它们。省略了，文章就会急转直下，使人感到突冗。
转折，指两层意思的转换。在论文中也同样有段落作转折，有句子作转折，也有词语作转折。比如有一学员对传统劳动用工制度进行剖析，先实事求是地论述了我国国有企业实行的固定工制度曾经起过作用，接着要论述这种固定工制度的实行越来越不适应社会经济的发展，带来了一系列问题，中间就以“但是由于长期来片面地把人人就业当作社会主义制度的优越性看待，由此带来了两大问题”，这就是以句子作为转折，使上下文之间显得转折得体、自然。此外，我国传统的转折手法还有提法(明转)、驻法(暗转)，有急转、缓转，有在前头富开一笔勾魂动魄的后转，也有篇末暗送秋波的前转。具体选取何种方法转折，要看具体情况而定。